長崎の海外交流史やキリシタン禁制の歴史を扱う展示室には、教科書に登場する資料が多数展示されています。子ども向け解説パネルもあるので歴史学習や長崎の郷土学習にぴったりです。
展示室にある5つの体験コーナーでは、触る、香りを嗅ぐ、組み立てる、人物になりきる、などの体験を通じて 自ら発見し、楽しみながら学ぶことができます。